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本科成果一作!211,發(fā)Cell!

  11月12日,西北大學(xué)首屆華大創(chuàng)新班畢業(yè)生,生命科學(xué)學(xué)院姚佳俊在本科聯(lián)合培養(yǎng)期間參與的華大生命科學(xué)研究院研究項目成果,以共同第一作者在國際頂級生物學(xué)期刊《細(xì)胞》(Cell)在線發(fā)表,論文題為Spatiotemporal modeling of molecular holograms,西北大學(xué)為共同第一作者單位。

  論文鏈接:

  https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01159-0

  該論文由華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院等機構(gòu)合作研究,借鑒物理學(xué)、地理學(xué)、經(jīng)濟學(xué)等多個跨學(xué)科領(lǐng)域的數(shù)學(xué)模型,開創(chuàng)性開發(fā)了三維時空建模工具包Spateo,使空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)能夠精細(xì)地重構(gòu)器官三維結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)地量化時空動態(tài)過程。該工具包的發(fā)布標(biāo)志著時空組學(xué)研究迎來革新性突破,可全面支撐胚胎發(fā)育、腦科學(xué)、疾病等領(lǐng)域研究,為實現(xiàn)高精度時空生命全景觀研究邁出了極為關(guān)鍵的一步。

  在該成果中,姚佳俊和研究團隊開發(fā)了Spateo的3D時空建模框架,并將其成功應(yīng)用于E9.5和E11.5的3D小鼠胚胎發(fā)生圖譜的繪制,捕獲了高達(dá)800萬個細(xì)胞的數(shù)據(jù),為胚胎發(fā)育研究提供了寶貴的資源。

  姚佳俊在該研究中主要負(fù)責(zé)3D模型的生成、形態(tài)測量與體積分析、形態(tài)學(xué)骨架構(gòu)建、形態(tài)發(fā)生預(yù)測以及開發(fā)Spateo-viewer可視化工具。

  華大創(chuàng)新班

  2018年9月,西北大學(xué)首屆華大創(chuàng)新班學(xué)生入校,采取“3+1”校企聯(lián)合培養(yǎng)模式,即學(xué)生在西北大學(xué)完成三年本科教育后,前往深圳華大集團進行為期一年的學(xué)習(xí)實踐。

  2024年新設(shè)立的西北大學(xué)5個創(chuàng)新實驗班之一——生物科學(xué)(華大創(chuàng)新班)是西北大學(xué)與華大集團根據(jù)雙方人才培養(yǎng)的創(chuàng)新機制和教學(xué)資源優(yōu)勢,在新時期依托國家級一流專業(yè)生物科學(xué)、省級生物科學(xué)基礎(chǔ)學(xué)科拔尖學(xué)生培養(yǎng)基地2.0設(shè)立的創(chuàng)新教學(xué)模式。

  華大創(chuàng)新班的人才培養(yǎng),得到了華大集團的全力支持。近日,在西北大學(xué)生物學(xué)科辦學(xué)100周年活動中,華大集團董事長汪建,中國科學(xué)院院士、華大集團聯(lián)合創(chuàng)始人楊煥明,華大集團副總裁、西北大學(xué)92級優(yōu)秀校友楊爽來校,指導(dǎo)華大創(chuàng)新班人才培養(yǎng)并鼓勵同學(xué)們不斷追求卓越和創(chuàng)新。

  

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